Ad una pergamena ravennate deĺla fine del ' 200 risale la piu' antica menzione di un luogo di culto all' interno dell' abitato del "Castrum" di Cattolica, ma la prima esplicita citazione di una chiesa dedicata a Sant' Apollinare e' del 1313.
Nel 1515, Paoa Giulio II concesse la chiesa all' Abbazia di San Vitale, così che per quasi tutto il secolo(fino al 1592) essa viene retta dai monaci benedettini.