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La historia de Nuevo Quito, comienza desde los años 1970, cuando jefes de familia provenientes de la provincia de Loja, en particular del que hoy es el cantón Calvas; después del soportar la sequía, inician un viaje en busca de tierras más productivas, aquellos recorrieron caminos de herradura y un extenso río, hoy conocido como el Nangaritza, encontraron terrenos ya habitados por los Shuar, éstos fueron negociadas y comprados para luego formar la comunidad de Nuevo Quito, cuyo nombre se debe a la fecha de creación coincidía con la fundación de la capital del Ecuador “Quito”. Alrededor del año de 1963 arribaron los nómadas Shuar provenientes de la provincia de Morona Santiago para, en años posteriores llegar a formar los centros Shuar que hoy se denominan: San Antonio cuyo nombre se debe su fundador, el Sr Antonio Sarango, o cerro flautero debido que sus relieves estaban rodeados de carrizos para elaborar flautas, San Luis lleva el nombre de su fundador Don Luis Manchai debido al hecho que en las orillas del río que atraviesa la comunidad existía bastante guadua (bambú). En el año de 1981 indígenas provenientes del cantón Saraguro buscando un mejor porvenir en tierras más productivas llegan a conformar un asentamiento poblacional en Mayaicu para luego constituir el barrio de CISAM o “Centro Indígena de Saraguros Asentados en Mayaicu”, nombre con el que ellos se identifican y en la misma época arriban colonos que junto con nativos de la etnia Shuar llegan a fundar la comunidad la Libertad o espacio libre ubicado entre lo que ahora son las comunidades de CISAM y KENKUIM, de este hecho se deriva su nombre. Alrededor del año de 1983 mestizos, en busca de mejores oportunidades encuentran una tierra de prometedora riqueza minera, en particular de oro, también ya ocupada por nativos de la etnia Shuar. Ésta tierras les proporcionó ingresos requeridos para el sustento diario de sus familias. En años venideros llegan a formar los asentamientos mineros que en la actualidad se llaman La Herradura cuyo nombre se debe a un herraje encontrado en aquel sitio, Puerto Minero ya que es un sitio donde la gente que labora en la minería encuentra lo necesario para desarrollar ésta actividad y La Pangui sitio, donde se encuentra la Bocamina y el Mirador como atractivos turísticos. Es necesario marcar relevancia, que al hecho que Nuevo Quito fue escenario directo de los enfrentamientos bélicos entre Ecuador y Perú ocurrido en los años 1981 y 1995 en el cuál fueron parte de este acontecimiento histórico, el minero, el agricultor y el ganadero de la etnia Shuar, Indígena, Mestizo y Afro ecuatoriano.
La parroquia Nuevo Quito está localizada al Sur del País, territorialmente en la región 7, Provincia de Zamora Chinchipe, Cantón Paquisha.
La parroquia Nuevo Quito tiene doce asentamientos poblacionales, distribuidos en toda el área territorial de la parroquia.